北京市京圃園生物工程有限公司是由北京市科委批準的高新技術企業。公司成立于1998年，依托中國農業科學院的技術優勢，主要從事農業微生物、環保工程、土壤肥料、綠色農業種植等產業項目的技術開發及產品生產。目前公司擁有中高級技術人員16人。
1998年 京圃園生物工程有限公司注冊成立，開始涉及生態農業領域。
1999年 公司專家隊伍在造成我國農村主要污染物的畜禽糞便的無害化處理的研究上取得重大突破。采用微生物發酵技術，使之除臭，腐熟成為有機農業種植所必需的高效、優質的生物有機肥。
2000年 有機廢物發酵菌曲研制成功，并嘗試運用特許加盟的方式帶動下游產業的發展。
2001年 公司生產的“有機廢物發酵菌曲”取得農業部頒發的登記證書，標志著我國發酵劑產品完全依賴進口的結束。
2002年 七月，全國人大副委員長姜春云視察“圃園”加盟企業，并對企業為現代農業生態 系統所做的貢獻表示贊揚；十月，公司生產的“生物有機肥”成為首批取得農業部頒發登記證的產品。
2003年 “有機廢物微生物發酵生產生物有機肥”技術通過了以國家環保總局金鑒明院士為專家委員會主任的成果鑒定，成為國內同行業中第一家具有知識產權并通過省部級鑒定的技術。
2004年 五月，公司承擔國家級火炬計劃項目“有機廢物微生物發酵生產生物有機肥” 技術；七月，公司被批準為北京市高新技術企業；十月，“有機廢物微生物發酵生產生物有機肥” 技術被評為北京市金橋獎項目。
2005年 三月，“有機廢物微生物發酵生產生物有機肥” 技術被評為“2005年國家重點環境保護實用技術（A類）”；五月，公司承擔國家級星火計劃項目“有機廢棄物微生物發酵劑及生物有機肥產業化開發”；十月，該項目榮獲第二屆中國??東盟博覽會先進實用技術專題展優秀參展項目；十一月，該項成果通過國家環保總局環境保護科技成果登記。
2006年 該項技術被評為2005年國家環境保護科學技術獎。
2007年 “圃園”體系下已經發展全國各地40多家加盟企業，“圃園”生態農業體系初現規模。
2008年 公司在丹麥政府及丹麥駐華大使館的支持下，與丹麥循環利用中心共同出資在中國組建了合資子公司。引進丹麥、德國先進技術處理中國污水，進軍環保市場，從而進一步詮釋了我公司“立足環保，面向農業”的發展理念。