1、防暑：水蛭在超過30度的情況下最容易中暑，其主要表現為停止吃食，不定期的從養殖的池塘里游向岸邊，有的被烈日曬傷而燙死，此時的水蛭最為不安，停止生長。具體處理措施為，有條件的在養殖基地的上部照上太陽網，在藕田里或稻田的等其它有遮擋物的養殖基地里應該在早上或傍晚用抽水機陸續的注入新水，這樣可有效的防治并且可以讓水蛭有新鮮的氧氣。同時應該另外在用“呋喃唑酮”全池潑撒，也可以防治水蛭的腸炎。
2、防洪：應該提前把養殖基地的周圍水溝疏通，且把水蛭養殖基地的溢水口全部打開，同時把出水處的紗網檢查一下，謹防水蛭順著洪水逃跑
3、防逃。要在池塘外圍砌防逃墻，墻高80-90厘米，地下部分在30厘米以上，墻內側用水泥、沙子抹成麻面（墻面越光滑水蛭越容易逃跑）。
4、多放養水生植物。以水葫蘆和浮萍為主，因為水蛭怕陽光直射，水葫蘆和浮萍既是田螺的飼料，又可為水蛭遮光，水蛭還可以在上面產卵。
5、投入足量的田螺。田螺應選擇體型大的。
6、引種后不得直接將水蛭投放到池塘里。因為在運輸過程中水蛭自身會產生一層黏膜作為保護層，應先將水蛭放到池塘周邊一塊陰涼潮濕的地方，讓水蛭自然爬進池塘，以減少死亡。
7、保持合適水位。水蛭繁殖是在覆蓋物下邊的泥土中，并不是在水中繁殖。在繁殖期如果水漫過土床7天左右，水蛭卵會因缺氧而死亡，要注意保持合適的水位，以確保養殖成功。
8、分級處理：捕撈的水蛭按大、中、小分開，大的篩選出來放回池中留做種蛭，小的放在另外一個池子中繼續養，第二年達到商品規格時起捕出售，中等的馬上加工成干品出售。
9、水蛭養殖過程中不能施用化肥和農藥。